Первое упоминание о пустынножительстве на острове связано с именем схимонаха Порфирия (Безсонова), который жил здесь в отшельничестве в 1827-28 годах (в 1828 г трагически погиб, провалившись под лед по пути в монастырь, похоронен в ските Всех Святых).

«Порфирий однажды вечером, в осеннее время, посетил старцев скита, от которого невдалеке была его пустыня. Когда он прощался со старцами, они предостерегали его, говоря: ”Не вздумай пройти по льду: лед только что встал и очень тонок”. Пустыня Порфирия отделялась от скита глубоким заливом Ладожского озера, который надо было обходить. Схимонах ответил тихим голосом, с наружною скромностью: ”Я уже легок стал”. Он ушел. Через короткое время услышали отчаянный крик…»

С 1915 по 1937 г. традицию пустынножительства на о. Порфирьевском продолжил схиигумен Феодор (Пошехов), принявший схиму в 1921 г. При нем здесь были построены часовня в честь прп. Серафима Саровского, келейный дом и несколько хозяйственных помещений, разбиты сад и огород, выкопан прудик для полива.

В 1930-е годы о. Феодор получил благословение принимать у себя в пустыньке паломников (это были, прежде всего, русские эмигранты).

Согласно их воспоминаниям, старец проявлял великую любовь и милосердие ко всем посетителям, с присущей ему простотой преподавал духовные наставления, каждого старался утешить, обласкать, воодушевить, любил при этом угощать или чаем, или плодами своего сада и огорода.

После его кончины в 1937 г. (похоронен на Старом Братском кладбище монастыря) в пустыни несколько месяцев прожил его духовный сын иеромонах Иоиль (Волынин). Примечательно, что о. Иоилю несколько раз во сне являлся почивший схиигумен Феодор и предупреждал его: «Поезжай в монастырь!». Но он, следуя святоотеческой традиции, не обращал внимания на сны. В декабре 1937 г о. Иоиль мирно почил в пустыньке без всякой предшествующей болезни.

С этого момента Порфирьевский остров опустел. В годы 2-й мировой войны на нем хозяйничали финские военные.

В советский период все его постройки были утрачены, сохранились лишь фундаменты, подпорные стены, посадки малины и смородины.

И. А. Матвеева.

А вот о.Феодор ходит в храм и как иерей служит только в воскресные и праздничные дни. … Но зато о.Феодор весь день непрерывно творит молитву Иисусову и зато он все дни напролет проводит за работой. Ею он увлечен, это родная стихия — матушка-землица — для русского мужичка. А тут и землицы-то нет, все камни, луда. Вот и приходится самому ему «творить из ничего» землицу-то. Носит, собирает щепочки, да елочные иглы, да листья, и все это компостную яму образует, перегорит, и землица получается, да какая славная. «Насыпешь ее, малинку посадишь, огурчики поспеют, во какие вырастут. Вот посмотри, посмотри как малинка-то разошлась. Потом и кровью добыта. Поранишь руку, кровь-то твоя и окропит земличку. Вот и родит она, милая, сам-сот», — так и льется, так и льется журчанье его, бодрое, веселящее. И оживают перед тобою кустики его, друзья его ненаглядные. С ними сроднился, сжился за двадцать лет. Это все детки его духовные, духом его пропитанные.

В августе 2013 г внутри фундамента разрушенной часовни был установлен крест.

А в 2015 г было принято решение об основании на Порфирьевском острове нового скита во имя прп. Серафима Саровского Чудотворца.

За 3 года удалось провести серьезный объем работ: благоустройство территории на площади свыше 1,5 га, прокладку более 300 м дренажных труб, подведение инженерных сетей, строительство причала, келейного дома, часовни в честь св. благ.кн. Александра Невского (точная копия утраченной часовни прп. Серафима Саровского) и скитского храма.

Все постройки скита выполнены из соснового бруса. Часовня и келейный корпус – силами петербургской компании «Технопарк».

Деревянная, рубленная “в обло”, церковь Богоявления (1674 г.; перестроена в 1730 году) некогда стояла в селе Семеновском Пушкинского района Московской области. Особо ценный памятник архитектуры Подмосковья, в 1970 г она была перевезена в Истру на территорию областного музея деревянного зодчества. Интерьер церкви украшал тябловый иконостас с иконами XVI — XVII веков, которые в 1966 году были переданы в Музей древнерусской культуры и искусства им. Андрея Рублева. Храм на подклете с пятигранным прирубленным алтарем и трапезной, над которой когда-то возвышалась шатровая звонница, был, пожалуй, лучшим экспонатом музея. После перевозки в Истру храм реставрировали, стараясь вернуть ему первоначальный облик. Специалисты отмечали, что редкий для Подмосковья памятник церковного деревянного зодчества прекрасно сохранял архитектурно-конструктивную основу XVII — XVIII веков. Церковь Богоявления из села Семеновское сгорела в сентябре 2000 года в результате замыкания электропроводки. Пожарные боролись с огнем в течение часа, но отстоять памятник не смогли.