На техногенных почвах росли не только сады, но и аллеи и рощи широколиственных и хвойных деревьев, необычных для этих широт. Аллеи стройных пихт, могучих лиственниц, светлых ясеней, узорчатых кленов встречают путников на подходе к скитам, соединяют в единый комплекс разбросанные по острову монашеские постройки, придают ансамблевость комплексу. Рощи из дуба, кедра, липы и тополя были высажены так, чтобы они не скрывали фасады зданий, не препятствовали их обзору. Искусственные посадки обогатили естественную природу острова, внесли в нее новые краски, превратили Валаам в своеобразный лесопарк.
От центральной усадьбы монастыря к Игуменскому кладбищу ведет одна из самых живописных дорог на Валааме. Начинается она как аллея сибирской пихты. Деревья высажены часто, у каждого дерева в молодом возрасте была подрезана и расщеплена вершина Это вызвало разделение ствола на 2 — 3, а иногда и на 4 ветви, что сильно увеличило густоту аллеи, сделало ее хорошей защитой от ветров для лежащих с юга полей и огородов. В аллее было 370 деревьев, сохранилось 242 дерева в возрасте около 100 лет — к сожалению, пихты сильно подвержены ветровому повалу.
В последние годы в аллее сделаны подсадки молодых деревьев, но это не решило проблемы ее восстановления, рядом со взрослыми могучими пихтами молодые деревца приживаются плохо. Может быть, нужна подсадка взрослых деревьев. Над этим еще предстоит работать лесоводам.
Продолжением пихтовой аллеи служит аллея лиственницы европейской. В аллее 244 дерева того же возраста, что и пихты. Кружево крон, сквозь которое пробиваются синева неба и яркие солнечные лучи, создает торжественно-приподнятое настроение — оно должно было возникать у монастырской братии на пути к месту вечного упокоения. В конце лиственничной аллеи, как раз напротив кладбищенских ворот, во второй половине XIX века был заложен питомник дуба черешчатого. Когда-то молодые дубы из этого питомника использовались для создания аллей и рощ в разных районах острова. Теперь дубы в питомнике выросли, создали самостоятельную дубовую рощу в 238 стволов.